Popularni Postovi

Izbor Urednika - 2019

Istraživači otkrivaju način da se vrate unutar proteina kako bi vidjeli kako su ožičeni

Anonim

Bjelančevine u našem tijelu su sofisticirane strukture koje obavljaju određene poslove kako bi nam funkcionirali i zdravi. U mnogim slučajevima, ovi sićušni strojevi se uključuju ili isključuju kroz postupak u dva koraka, gdje jedan dio proteina šalje poruke na drugi dio pod nazivom "aktivno mjesto", što pokreće protein za pokretanje ili zaustavljanje posla. Ponekad je taj proces - poznat kao aloterij - poremećen, što dovodi do ili doprinosi razvoju određenih bolesti.

oglas


Razumijevanje kako je protein povezan može pomoći istraživačima da razviju načine kontrole svoje aktivnosti, a znanstvenici u Advanced Science Research Centru (ASRC) na Graduate Centeru, CUNY, vjeruju da su došli do pouzdanog načina da to odrede prema nedavno objavljena studija u eLifeu .

"Baš kao što je teško pogoditi kako se svjetlosna sklopka spaja na žarulju u sobi bez da gleda iza zidova, teško je predvidjeti koje je udaljeno područje proteina povezano sa svojim aktivnim mjestom bez da vide detalje unutar strukture, "rekao je Daniel Keedy, pomoćnik profesora s ASRC-ovom inicijativom za strukturne biologije i s odjelima za kemiju i biokemiju City College of New York.

Kako bi riješio ovu tajnu, Keedy i njegovi kolege istražili su signalizacijske sposobnosti proteinske tirozinske fosfataze 1B (PTP1B), a znanstvenici vjeruju da igraju značajnu ulogu u dijabetesu tipa 2 i vjerojatno raka dojke. Prvo su koristili rendgensku kristalografiju na različitim temperaturama kako bi vidjeli kako se atomi unutar proteina kreću. To je otkrilo specifična područja na kojima se atomi kreću poput brisača vjetrobrana ili Newtonove kolijevke za slanje poruka. Zatim je tim proveo velike propusne eksperimente s proteinom kako bi se utvrdilo koje se male molekule vežu na ove signalne lokacije.

"Ovaj proces u dva koraka omogućio nam je da vidimo ne samo gdje signalizacija potječe unutar PTP1B, već i ono što male molekule mogu slati poruke na aktivno mjesto. Ovo bi nam znanje moglo jednog dana pomoći razviti terapije koje šalju određene poruke za kontrolu aktivnost proteina i poremetiti razvoj dijabetesa tipa 2 ", rekao je Keedy.

"Ja sam vrlo oduševljen potencijalnim primjenama Danielovog rada", rekao je Kevin Gardner, direktor Inicijative za strukturne biologije ASRC-a i Einsteinov profesor kemije i biokemije na Gradskom fakultetu. "Ova tehnika pruža snažan eksperimentalni put da se pitaju gdje se male molekule mogu vezati za ciljeve bjelančevina, što omogućuje otkrivanje i razvoj lijekova pokazujući gdje bi se moglo naći prethodno neočekivano" uporište "za spojeve koji vežu i kontroliraju aktivnost proteina."

Keedy i njegovi kolege do sada su samo gledali PTP1B, ali njihova metoda koristi dostupne tehnologije koje se mogu koristiti za proučavanje procesa altera u mnogim drugim važnim bjelančevinama unutar našeg tijela. Nadaju se da će stjecati novo shvaćanje kako se kontroliraju funkcije tih drugih proteina, što bi moglo biti korisno za budući razvoj novih lijekova.

oglas



Izvor priče:

Materijali koje pruža Advanced Science Research Center, GC / CUNY . Napomena: Sadržaj se može uređivati ​​za stil i duljinu.


Referenca dnevnika :

  1. Daniel Keedy, Zachary B Hill, Justin T Biel, Emily Kang, T Justin Rettenmaier, José Brandão-Neto, Nicholas M Pearce, Frank von Delft, James A Wells, James S Fraser. Proširena alosterička mreža u PTP1B kristalografijom višestruke temperature, skeniranjem fragmenta i kovalentnim povezivanjem . eLife, 2018; 7 DOI: 10.7554 / eLife.36307